| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|
Data corrente: |
03/05/2005 |
|
Data da última atualização: |
10/05/2022 |
|
Autoria: |
DALMOLIN, C. C.; SILVA, F. R. da; MELLO, L. V.; RIGDEN, D. J.; CASTRO, M. E. B. de. |
|
Título: |
Nucleotide sequence and phylogenetic analyses of the DNA polymerase gene of Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus. |
|
Ano de publicação: |
2005 |
|
Fonte/Imprenta: |
Virus Research, v. 110, n. 1-2, p. 99-109, 2005. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
The DNA polymerase from Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) was identified and sequenced, and its amino acid sequence was compared with other viral DNA polymerases to identify conserved regions and to reconstruct a phylogenetic tree. The sequence analysis of the AgMNPV DNA polymerase gene revealed the presence of a 2976 nucleotides open reading frame (ORF) encoding a polypeptide of 991 amino acid residues with a predicted molecular mass of 114.7 kDa. Among the baculovirus DNA polymerase genes identified to date, the AgMNPV DNA polymerase gene shared maximum amino acid sequence identity with the DNA polymerase gene of Choristoneura fumiferana nucleopolyhedrovirus defective strain (CfDEFNPV) (94%). The alignment of 140 virus sequences, 23 of them from baculovirus, showed that, of the 10 conserved regions identified, 5 are exclusive to baculoviruses (R1, R5, R9, R6 and R10), only 2 of them (R6 and R10) previously described as such in the literature. Our analysis, based on their positions in the AgMNPV DNA polymerase model, suggests that R9 and R10 could interact with DNA. Phylogenetic analysis of DNA polymerase sequences places the enzyme from AgMNPV within the cluster containing the polymerases of Group I Nucleopolyhedrovirus and suggests that the AgMNPV DNA polymerase is more closely related to that of CfDEFNPV than to those of other baculoviruses. |
|
Palavras-Chave: |
Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus; Gene DNA polimerase. |
|
Thesagro: |
Filogenia. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02049naa a2200205 a 4500
001 1185643
005 2022-05-10
008 2005 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aDALMOLIN, C. C.
245 $aNucleotide sequence and phylogenetic analyses of the DNA polymerase gene of Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus.$h[electronic resource]
260 $c2005
520 $aThe DNA polymerase from Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) was identified and sequenced, and its amino acid sequence was compared with other viral DNA polymerases to identify conserved regions and to reconstruct a phylogenetic tree. The sequence analysis of the AgMNPV DNA polymerase gene revealed the presence of a 2976 nucleotides open reading frame (ORF) encoding a polypeptide of 991 amino acid residues with a predicted molecular mass of 114.7 kDa. Among the baculovirus DNA polymerase genes identified to date, the AgMNPV DNA polymerase gene shared maximum amino acid sequence identity with the DNA polymerase gene of Choristoneura fumiferana nucleopolyhedrovirus defective strain (CfDEFNPV) (94%). The alignment of 140 virus sequences, 23 of them from baculovirus, showed that, of the 10 conserved regions identified, 5 are exclusive to baculoviruses (R1, R5, R9, R6 and R10), only 2 of them (R6 and R10) previously described as such in the literature. Our analysis, based on their positions in the AgMNPV DNA polymerase model, suggests that R9 and R10 could interact with DNA. Phylogenetic analysis of DNA polymerase sequences places the enzyme from AgMNPV within the cluster containing the polymerases of Group I Nucleopolyhedrovirus and suggests that the AgMNPV DNA polymerase is more closely related to that of CfDEFNPV than to those of other baculoviruses.
650 $aFilogenia
653 $aAnticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus
653 $aGene DNA polimerase
700 1 $aSILVA, F. R. da
700 1 $aMELLO, L. V.
700 1 $aRIGDEN, D. J.
700 1 $aCASTRO, M. E. B. de
773 $tVirus Research$gv. 110, n. 1-2, p. 99-109, 2005.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
06/08/2002 |
|
Data da última atualização: |
30/04/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
Nacional - B |
|
Autoria: |
TEIXEIRA, A. H. de C.; AZEVEDO, P. V. de. |
|
Afiliação: |
ANTONIO HERIBERTO DE C TEIXEIRA, CPATSA. |
|
Título: |
Zoneamento agroclimático para a videira europeia no Estado de Pernambuco, Brasil. |
|
Ano de publicação: |
1996 |
|
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Agrometeorologia, Santa Maria, v. 4, n. 1, p. 139-145, 1996. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Utilizando-se índices climáticos baseados no balanço hídrico e nas temperaturas médias do ar foram delimitadas as áreas com diferentes aptidões climáticas para o cultivo da videira européia (Vitis vinifera L.) no Estado de Pernambuco, Brasil. Primeiramente calculou-se o balanço hídrico pelo método de Thornthwaite & Mather - 1955 utilizando 125 mm de retenção de água no solo, com dados climatológicos das regiões de dispersão natural e de cultivo comercial da espécie. Com os dados destes balanços determinou-se o índice hídrico anual de Thornthwaite (1948)(Ih) caracterizando o grau de umidade do clima ideal para a cultura. A seguir, utilizando os valores de temperatura do ar e de precipitação pluvial mensais de 124 localidades do Estado, calcularam-se os balanços hídricos para a mesma capacidade de armazenamento de água no solo. Constatou-se que não há limitação térmica para o cultivo da espécie em Pernambuco, portanto as zonas com aptidão plena foram subdivididas de acordo com os valores de temperatura media do mês mais quente (Tq) de cada local considerado. A sobre-posição das isolinhas de Tq e Ih no Estado, resultou nas seguintes classes de aptidão agroclimática: Aptidão plena (A): (Ih < -40) sendo A1 (Tq > 20oC) e A2(26oC < Tq < 28oC); Aptidão plena (B): (-40 < Ih < -20) sendo B1 (26oC < Tq < 28o) e B2 (240C < Tq < 26o); Aptidão regular (C): (-20 < Ih < 0); Aptidão regular (D): (0 < Ih < 20); Aptidão restrita (E): (20 < In < 6); Inaptidão (F): (Ih > 60). |
|
Palavras-Chave: |
Agroclimatic zonation; Grape; Pernambuco; Uva européia. |
|
Thesagro: |
Balanço Hídrico; Uva; Vitis Vinifera; Zoneamento Climático. |
|
Thesaurus NAL: |
water balance. |
|
Categoria do assunto: |
--
A Sistemas de Cultivo |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176138/1/ID-8369-Revista-Brasileira-de-agrometeorologia-Vol.4-n.1.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02258naa a2200241 a 4500
001 1133576
005 2018-04-30
008 1996 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aTEIXEIRA, A. H. de C.
245 $aZoneamento agroclimático para a videira europeia no Estado de Pernambuco, Brasil.
260 $c1996
520 $aUtilizando-se índices climáticos baseados no balanço hídrico e nas temperaturas médias do ar foram delimitadas as áreas com diferentes aptidões climáticas para o cultivo da videira européia (Vitis vinifera L.) no Estado de Pernambuco, Brasil. Primeiramente calculou-se o balanço hídrico pelo método de Thornthwaite & Mather - 1955 utilizando 125 mm de retenção de água no solo, com dados climatológicos das regiões de dispersão natural e de cultivo comercial da espécie. Com os dados destes balanços determinou-se o índice hídrico anual de Thornthwaite (1948)(Ih) caracterizando o grau de umidade do clima ideal para a cultura. A seguir, utilizando os valores de temperatura do ar e de precipitação pluvial mensais de 124 localidades do Estado, calcularam-se os balanços hídricos para a mesma capacidade de armazenamento de água no solo. Constatou-se que não há limitação térmica para o cultivo da espécie em Pernambuco, portanto as zonas com aptidão plena foram subdivididas de acordo com os valores de temperatura media do mês mais quente (Tq) de cada local considerado. A sobre-posição das isolinhas de Tq e Ih no Estado, resultou nas seguintes classes de aptidão agroclimática: Aptidão plena (A): (Ih < -40) sendo A1 (Tq > 20oC) e A2(26oC < Tq < 28oC); Aptidão plena (B): (-40 < Ih < -20) sendo B1 (26oC < Tq < 28o) e B2 (240C < Tq < 26o); Aptidão regular (C): (-20 < Ih < 0); Aptidão regular (D): (0 < Ih < 20); Aptidão restrita (E): (20 < In < 6); Inaptidão (F): (Ih > 60).
650 $awater balance
650 $aBalanço Hídrico
650 $aUva
650 $aVitis Vinifera
650 $aZoneamento Climático
653 $aAgroclimatic zonation
653 $aGrape
653 $aPernambuco
653 $aUva européia
700 1 $aAZEVEDO, P. V. de
773 $tRevista Brasileira de Agrometeorologia, Santa Maria$gv. 4, n. 1, p. 139-145, 1996.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
